MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 1

Total Repeats: 144785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014210	TGGTC	2	10	336	345	0 %	40 %	40 %	20 %	297558986
2	NC_014210	GC	3	6	391	396	0 %	0 %	50 %	50 %	297558986
3	NC_014210	AAG	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297558986
4	NC_014210	CGACC	2	10	559	568	20 %	0 %	20 %	60 %	297558986
5	NC_014210	CGC	2	6	582	587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
6	NC_014210	CGC	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
7	NC_014210	CCG	2	6	603	608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
8	NC_014210	CGCC	2	8	651	658	0 %	0 %	25 %	75 %	297558986
9	NC_014210	CGT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558986
10	NC_014210	CGG	2	6	714	719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
11	NC_014210	CG	3	6	766	771	0 %	0 %	50 %	50 %	297558986
12	NC_014210	GGC	2	6	784	789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
13	NC_014210	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
14	NC_014210	CTG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558986
15	NC_014210	ACC	2	6	870	875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297558986
16	NC_014210	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
17	NC_014210	CGCGCC	2	12	913	924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
18	NC_014210	CAG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
19	NC_014210	C	6	6	948	953	0 %	0 %	0 %	100 %	297558986
20	NC_014210	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
21	NC_014210	GGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
22	NC_014210	GAG	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
23	NC_014210	GGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
24	NC_014210	GAG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
25	NC_014210	GGA	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
26	NC_014210	CTC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297558986
27	NC_014210	AGG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
28	NC_014210	CCG	2	6	1220	1225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
29	NC_014210	CG	3	6	1234	1239	0 %	0 %	50 %	50 %	297558986
30	NC_014210	GGC	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
31	NC_014210	CGG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
32	NC_014210	CTG	2	6	1388	1393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558986
33	NC_014210	GGA	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
34	NC_014210	TCA	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297558986
35	NC_014210	CCG	3	9	1513	1521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
36	NC_014210	TGG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558986
37	NC_014210	AGG	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
38	NC_014210	TTC	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297558986
39	NC_014210	GCC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
40	NC_014210	AGC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
41	NC_014210	GGA	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
42	NC_014210	GCC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
43	NC_014210	AAG	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297558986
44	NC_014210	AGG	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558986
45	NC_014210	GGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
46	NC_014210	CCA	2	6	1836	1841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297558986
47	NC_014210	GC	3	6	1860	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	297558986
48	NC_014210	TGGACC	2	12	1908	1919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297558986
49	NC_014210	CCAG	2	8	1923	1930	25 %	0 %	25 %	50 %	297558986
50	NC_014210	TGC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558986
51	NC_014210	CGG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558986
52	NC_014210	GCC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558986
53	NC_014210	GCA	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558986
54	NC_014210	ACCAC	2	10	2145	2154	40 %	0 %	0 %	60 %	297558986
55	NC_014210	CG	3	6	3447	3452	0 %	0 %	50 %	50 %	297558987
56	NC_014210	CGGTGC	2	12	3473	3484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297558987
57	NC_014210	TCG	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558987
58	NC_014210	CTG	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558987
59	NC_014210	CAG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558987
60	NC_014210	GTCGAG	2	12	3583	3594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297558987
61	NC_014210	GTC	3	9	3691	3699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558987
62	NC_014210	CGG	2	6	3702	3707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558987
63	NC_014210	ACC	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297558987
64	NC_014210	GGA	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558987
65	NC_014210	CGC	3	9	3804	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558987
66	NC_014210	GTGGCC	2	12	3823	3834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297558987
67	NC_014210	CGA	2	6	3843	3848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558987
68	NC_014210	ACCG	2	8	3913	3920	25 %	0 %	25 %	50 %	297558987
69	NC_014210	CGG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558987
70	NC_014210	GCG	2	6	4097	4102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558987
71	NC_014210	GCC	2	6	4103	4108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558987
72	NC_014210	CAC	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297558987
73	NC_014210	GCT	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558987
74	NC_014210	TCG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558987
75	NC_014210	GAG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558987
76	NC_014210	CGA	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558987
77	NC_014210	TCC	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297558987
78	NC_014210	CAC	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297558987
79	NC_014210	GGA	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558987
80	NC_014210	TCC	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297558987
81	NC_014210	GGC	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558988
82	NC_014210	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558988
83	NC_014210	GTC	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558988
84	NC_014210	ACG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558988
85	NC_014210	TCGCC	2	10	4726	4735	0 %	20 %	20 %	60 %	297558988
86	NC_014210	GCC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558988
87	NC_014210	C	6	6	4783	4788	0 %	0 %	0 %	100 %	297558988
88	NC_014210	GGT	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558988
89	NC_014210	G	6	6	4883	4888	0 %	0 %	100 %	0 %	297558988
90	NC_014210	GAC	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558988
91	NC_014210	GCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558988
92	NC_014210	GCC	2	6	4984	4989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558988
93	NC_014210	CAT	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297558988
94	NC_014210	CGG	2	6	5012	5017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558988
95	NC_014210	GAG	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558988
96	NC_014210	GCCC	2	8	5040	5047	0 %	0 %	25 %	75 %	297558988
97	NC_014210	GAG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558988
98	NC_014210	ATG	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297558988
99	NC_014210	GAC	2	6	5208	5213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558988
100	NC_014210	GTG	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558988
101	NC_014210	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558988
102	NC_014210	GGA	3	9	5291	5299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558988
103	NC_014210	GCC	2	6	5364	5369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558988
104	NC_014210	CCCGGC	2	12	5384	5395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558988
105	NC_014210	CCT	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297558988
106	NC_014210	CG	3	6	5414	5419	0 %	0 %	50 %	50 %	297558988
107	NC_014210	GAC	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558988
108	NC_014210	GGC	2	6	5462	5467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558988
109	NC_014210	CGG	2	6	5483	5488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558988
110	NC_014210	CGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558988
111	NC_014210	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558989
112	NC_014210	TCC	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297558989
113	NC_014210	C	6	6	5820	5825	0 %	0 %	0 %	100 %	297558989
114	NC_014210	GGT	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558989
115	NC_014210	CGA	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
116	NC_014210	CG	3	6	5940	5945	0 %	0 %	50 %	50 %	297558989
117	NC_014210	GGA	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558989
118	NC_014210	GCG	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558989
119	NC_014210	GAC	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
120	NC_014210	CTG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558989
121	NC_014210	GC	5	10	6050	6059	0 %	0 %	50 %	50 %	297558989
122	NC_014210	GGCG	2	8	6067	6074	0 %	0 %	75 %	25 %	297558989
123	NC_014210	AGC	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
124	NC_014210	CCGG	2	8	6132	6139	0 %	0 %	50 %	50 %	297558989
125	NC_014210	GCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558989
126	NC_014210	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558989
127	NC_014210	TGG	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558989
128	NC_014210	GCG	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558989
129	NC_014210	CCG	2	6	6350	6355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558989
130	NC_014210	GC	3	6	6385	6390	0 %	0 %	50 %	50 %	297558989
131	NC_014210	CCGCGA	2	12	6406	6417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297558989
132	NC_014210	GCG	2	6	6426	6431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558989
133	NC_014210	TGG	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558989
134	NC_014210	CGA	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
135	NC_014210	GCCA	2	8	6500	6507	25 %	0 %	25 %	50 %	297558989
136	NC_014210	GCC	2	6	6545	6550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558989
137	NC_014210	CTG	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297558989
138	NC_014210	GAC	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
139	NC_014210	GAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558989
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141	NC_014210	CCG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558989
142	NC_014210	G	6	6	6739	6744	0 %	0 %	100 %	0 %	297558989
143	NC_014210	GTGA	2	8	6753	6760	25 %	25 %	50 %	0 %	297558989
144	NC_014210	CGCGG	2	10	6951	6960	0 %	0 %	60 %	40 %	297558990
145	NC_014210	CGG	2	6	7085	7090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558990
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147	NC_014210	GGC	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558990
148	NC_014210	CG	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	297558990
149	NC_014210	GAG	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558990
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153	NC_014210	GGT	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297558991
154	NC_014210	CGA	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558991
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156	NC_014210	CGG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558991
157	NC_014210	CCG	2	6	8037	8042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297558991
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162	NC_014210	CGGCGT	2	12	8119	8130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297558991
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166	NC_014210	CGCC	2	8	8329	8336	0 %	0 %	25 %	75 %	297558991
167	NC_014210	CAA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297558991
168	NC_014210	CGA	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558991
169	NC_014210	CGG	2	6	8410	8415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297558991
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176	NC_014210	GAG	2	6	8630	8635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558991
177	NC_014210	TCCGC	2	10	8640	8649	0 %	20 %	20 %	60 %	297558991
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249	NC_014210	CGA	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558992
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257	NC_014210	GGA	2	6	11436	11441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297558992
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261	NC_014210	GAC	2	6	11569	11574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297558992
262	NC_014210	CTT	2	6	11586	11591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297558992
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496	NC_014210	TGC	2	6	20187	20192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297559000
497	NC_014210	GCC	2	6	20195	20200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297559000
498	NC_014210	TCTTCA	2	12	20262	20273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297559000
499	NC_014210	CGG	2	6	20386	20391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297559000
500	NC_014210	GCT	3	9	20416	20424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297559000

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